「腸道好，人不老」這是常聽到的廣告台詞。人體腸道住著幾百兆的細菌，是全身細胞的十倍之多。而在中醫在調節免疫，主要關鍵是看脾胃運化是否正常，這與免疫機能調控有很大的關聯性，腸道是人體最大的免疫器官，大約佔了有七成的免疫細胞，良好的免疫力能防止病毒入侵，更能維持身體健康、預防老化。
當腸道內好菌被壞菌占了優勢時，就是「腸道菌叢失衡」，並不是只有腹瀉、脹氣這麼簡單的腸道問題而已，還有可能造成許多全身性的疾病。所以重點不在好壞菌，而是如何維持好、壞菌的平衡才是關鍵。
我們常見好的細菌有：嗜酸乳桿菌 (A菌)、比菲德氏菌 (B菌)、長雙歧桿菌(龍根菌)…等，對腸道可帶來有益的影響，稱之為「益生菌」；而常見壞的細菌有：大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、白色念珠菌…等，這些壞菌都會讓我們生病。
腸道菌叢不對了～相關疾病
一、腸胃不適
1. 腸道黏膜發炎受損：當腸道壞菌過多時，壞菌會產生許多毒素造成腸道發炎、腸黏膜受損，使得腸道通透性變大（腸漏症 Leaky Gut)，使得本來不應該進入血液的物質進入血液當中，免疫細胞會將其視為外來敵人，因此啟動了免疫反應，這也是造成食物過敏與自體免疫的重要原因之一。
2. 脹氣腹瀉：當好菌不足就無法吸附在腸道黏膜上生長，形成保護膜，避免壞菌和雜菌黏附在黏膜上，無法加速壞菌的排除及預防壞菌生長。另外，旅行者腹瀉、抗生素引起的腹瀉，也都是腸道菌叢失衡所導致的。
3. 腸躁症：目前已知腸躁症與緊張、壓力…等神經系統方面有關，也與腸道壞菌有關。
二、免疫失衡
1.過敏：腸道是人體最大的免疫器官，70％免疫球蛋白抗體聚集在腸道，而腸道細菌則可與免疫細胞「溝通」，當腸道壞菌太多時，壞菌帶給免疫細胞錯誤的訊息，將導致免疫系統失衡及錯亂，因此產生過敏與自體免疫的現象。
2.自體免疫疾病：是免疫系統錯亂去攻擊自己的細胞與組織，而免疫系統的錯亂與腸道細菌提供的訊息有關。
3.私密處感染：陰道益生菌會分泌有機酸使陰道維持在弱酸環境(pH值3.8~4.5)，防止細菌在陰道生長。當益生菌減少時，使女性容易罹患慢性發炎。
三、肝臟疾病
肝臟及腸道中存在著所謂的肝-腸軸的密切關係，即腸道血液經由肝門脈系統供應含有激活肝臟功能的成份，而肝臟本身會分泌膽汁到腸管中來發揮其生理功能。因此，腸屏障(gut barrier)在肝臟疾病及其併發症致病中扮演的某種重要的角色。由於腸屏障是病原體及食物過敏原進入腸道的第一道防禦，因此益生菌在腸屏障障礙的維護上更扮演著極為重要的角色。
四、心理失調
腸道是第二大腦，腸道神經系統的複雜度跟大腦差不多，大腦和腸道神經系統之間靠迷走神經連結。腸道中的菌會透過腸道神經系統影響大腦中樞的運作，這是「腸腦軸線（gut–brain axis）」的基本原理。目前研究已證實，腸道菌相失衡，與憂鬱症、自閉症、過動症有關。
五、關節炎
美國羅徹斯特大學（University of Rochester）關節炎病學研究員Michael Zuscik博士，在骨關節炎分泌的滑液和滑膜組織中，可以偵測到細菌的DNA，這些細菌感染關節處的組織，造成磨損破壞，而活化的腸道益生菌，正可以抑制這些攻擊關節的壞菌，益生菌在循環代謝的過程中，也能減緩免疫反應，讓發炎情形不那麼嚴重。同時，在另一項類風濕性關節炎的動物實驗中，也發現腸道益生菌的作用相當於非類固醇消炎劑。
參考出處：退化性關節炎不是「退化」，原來是腸道少了益生菌 | Heho健康
誰殺了益生菌？腸道菌叢失衡的原因
一、精製食物 益生菌吃素（蔬果的膳食纖維）、壞菌吃葷（油脂、蛋白質），膳食纖維攝取不足，腸道益生菌沒有食物來源就餓死了。
二、壓力 壓力會抑制益生菌的生長，促進壞菌的生長，甚至減少腸道抗體(sIgA)的分泌。有研究指出，壓力造成腎上腺素、正腎上腺素…的分泌，而這些激素會促使壞菌生長。
三、藥物 過度使用抗生素、胃酸抑制劑，抗生素殺菌是不分好壞菌的，會將腸道好菌壞菌一起殺死。
四、發炎 「發炎」本身就可能造成益生菌減少、壞菌增加，菌叢失調。
增加腸道益生菌的方法
一、多吃發酵食物
日常的飲食中補充益生菌，可從優酪乳、優格、韓式泡菜、納豆以及味噌等，都有助於維護腸道健康。。
二、多吃益生質
益生質就是益生菌的食物，像是寡糖和水溶性膳食纖維，洋蔥、香蕉、牛蒡、蘋果、大蒜、蘆筍、豆類…等食物都含有益生質。
三、攝取足夠的膳食纖維
洋蔥、青蔥、大蒜、韭菜、牛蒡、蘆筍等高膳食纖維的食物都是腸道好菌愛吃的食物，吃高纖食物要多喝水才不會便秘，「飲食要多樣，才能養出多樣的好菌。」。另外，也要以全穀類和根莖類取代精製的白飯和白麵，這樣膳食纖維才能攝取足夠。
四、補充益生菌保健食品
建議選擇有經過篩選及鑑定的菌株較為安全，並挑選有包埋的益生菌可提高存活率，配方需有添加益生質，最好不要含輕瀉成分(番瀉葉、蘆薈素、鎂鹽、乳糖…等)。
六、多喝水、規律運動、排解壓力
遠離讓壞菌滋長的壞習慣，像是吃甜食、喝含糖飲料、高壓生活。臨床上發現長期處於負面情緒及壓力下，會使得免疫細胞數量減少，打亂免疫平衡，壓力荷爾蒙及腎上腺素增加，改變腸道菌行為，讓它們變得有侵略性，可能加重腸道發炎反應。
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